El nuevo centro será de tipología D4+B2, es decir, contará con cuatro líneas de Secundaria Obligatoria y dos de Bachillerato, lo que supondrá ofertar un total de 620 plazas escolares. El instituto se edificará sobre una parcela de 13.200 metros cuadrados ubicada en la confluencia de la avenida de la Sal y la calle Mar Azul, y alcanzará 4.974 metros cuadrados construidos, distribuidos en zona docente, área de administración, servicios comunes y espacios exteriores.
La parte docente de Secundaria estará compuesta por 16 aulas polivalentes con capacidad para 480 alumnos y alumnas, dos aulas de Música, Dramatización y Audiovisuales, aula de Educación Plástica y Audiovisuales, aula taller, dos aulas de desdoble y dos aulas de apoyo y refuerzo pedagógico.
Para Bachillerato habrá cuatro aulas polivalentes con capacidad para 140 estudiantes, aula de Dibujo, aula de desdoble y otra de apoyo y refuerzo pedagógico; así como tres laboratorios, que compartirá con las enseñanzas de ESO, y aula de Tecnología.
En la zona docente común se ubicarán diez departamentos, aula de Educación Especial con aseo adaptado, biblioteca, gimnasio con vestuarios y aseos. En el área de administración se localizarán los despachos de dirección, jefatura de estudios y secretario/a, sala de orientación, despacho para las asociaciones de padres y madres y del alumnado, conserjería y reprografía, secretaría y archivo y sala y aseos para el profesorado. Como servicios comunes, el centro dispondrá de cafetería y almacén, entre otros.
En las zonas exteriores, el nuevo IES de Almerimar tendrá porche cubierto, dos pistas polideportivas, área de juegos, huerto, área de estacionamiento de vehículos para el profesorado y zona ajardinada
